Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGF29Q96ES7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGF29Q96ES7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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