Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOPBP1Q92547 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms