Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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