Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-24P63145 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms