Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
UBE2E1P51965 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms