Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms