Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPB2P35606 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms