Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms