Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms