Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPS7BQ9H9Q2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPS7BQ9H9Q2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPS7BQ9H9Q2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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