Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSBP3Q9BWW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SSBP3Q9BWW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSBP3Q9BWW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms