Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLX1AQ9BQ83 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLX1AQ9BQ83 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms