Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUS1Q96E22 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUS1Q96E22 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUS1Q96E22 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms