Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM143Q96AN5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM143Q96AN5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms