Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms