Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC24A4Q8NFF2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC24A4Q8NFF2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms