Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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TMCO5AQ8N6Q1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO5AQ8N6Q1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO5AQ8N6Q1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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