Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MICAL3Q7RTP6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MICAL3Q7RTP6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MICAL3Q7RTP6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms