Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CSAG1Q6PB30 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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