Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2H3Q13889 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2H3Q13889 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2H3Q13889 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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