Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MTMR3Q13615 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTMR3Q13615 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTMR3Q13615 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
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