Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BPTFQ12830 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPTFQ12830 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BPTFQ12830 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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