Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK11-1P61568 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms