Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA4P41247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA4P41247 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms