Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT9P35527 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT9P35527 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT9P35527 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT9P35527 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT9P35527 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT9P35527 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT9P35527 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT9P35527 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT9P35527 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT9P35527 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT9P35527 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT9P35527 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT9P35527 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT9P35527 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT9P35527 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT9P35527 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT9P35527 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms