Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NID1P14543 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NID1P14543 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NID1P14543 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NID1P14543 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NID1P14543 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NID1P14543 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NID1P14543 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NID1P14543 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NID1P14543 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NID1P14543 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NID1P14543 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NID1P14543 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NID1P14543 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NID1P14543 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NID1P14543 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms