Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DEFA4P12838 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA4P12838 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms