Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HKR1P10072 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HKR1P10072 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HKR1P10072 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HKR1P10072 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HKR1P10072 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HKR1P10072 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HKR1P10072 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HKR1P10072 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HKR1P10072 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HKR1P10072 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HKR1P10072 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HKR1P10072 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HKR1P10072 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HKR1P10072 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HKR1P10072 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HKR1P10072 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HKR1P10072 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HKR1P10072 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HKR1P10072 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HKR1P10072 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms