Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM58BPP0C7Q3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM58BPP0C7Q3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM58BPP0C7Q3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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