Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACSL4O60488 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSL4O60488 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL4O60488 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms