Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTLC1O15269 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTLC1O15269 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTLC1O15269 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms