Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRDCB7Z8K6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRDCB7Z8K6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms