Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms