Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COPS8Q99627 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS8Q99627 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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