Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB2BQ9BVA1 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms