Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCF25Q9BQ70 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms