Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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DUSP18Q8NEJ0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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DUSP18Q8NEJ0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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DUSP18Q8NEJ0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DUSP18Q8NEJ0 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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