Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS8Q8N3P4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS8Q8N3P4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS8Q8N3P4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS8Q8N3P4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms