Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
R3HDM1Q15032 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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