Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEMA5AQ13591 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms