Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT13P13646 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT13P13646 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms