Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms