Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG16L1Q676U5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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