Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q499Y3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q499Y3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q499Y3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q499Y3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms