Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIRAP54198 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIRAP54198 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIRAP54198 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms