Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNA2P26232 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNA2P26232 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNA2P26232 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNA2P26232 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNA2P26232 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTNNA2P26232 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms