Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DENRO43583 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DENRO43583 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DENRO43583 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DENRO43583 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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