Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HBBP68871 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HBBP68871 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms