Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms