Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP5OP48047 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms